棘皮动物无神经节或神经中枢，神经位于体表或体壁中，与上皮细胞紧密相连。主要由口神经系（oral neural system）、下神经系（hyponeural
system）和反口神经系（aboral neural system）3个神经系组成。其中口神经系起源于外胚层发育，由神经环（nerve
）和辐神经（radial
nerves）组成，位于围血系统之下，司感觉，是棘皮动物最重要的神经结构。下神经系位于围血系统的管壁上，与口神经系平行；反口神经系位于反口而体壁内。海百合的反口神经系紧发达，是其最主要的神经结构，其他类群的反口神经系多不发达，有些类群（如海参）甚至消失。